Обычно в стеклянной банке содержится 700 г грибницы, в пакете — 350-400 г. Непосредственно перед заражением компоста их открывают. Содержимое извлекают на свет, отламывают кусочки размером с голубиное яйцо. Затем рукой или совком приподнимают слой приготовленного субстрата и на глубину 5-7 см помещают грибной кусочек. (Зерновой мицелий обычно рассыпается, и его при посеве используют горстями.) Уложив грибницу в одном месте, ее плотно прижимают приподнятым слоем компоста и переходят к посеву в следующем. Места посадки располагают в шахматном порядке на расстоянии 15-20 см друг от друга.
Зерновую грибницу можно сеять иным путем. Ее размельчают до отдельных зерен и посыпают ими поверхность грядки, руководствуясь нормой расхода на 1 м2. Потом грибницу накрывают слоем компоста толщиной 56 см. Около 1/3 предназначенной для посадки грибницы рассыпают сверху на поверхности грядки. Это делается для того, чтобы ускорить разрастание мицелия шампиньона в верхнем слое субстрата и защитить последний от развития вредных микроорганизмов, в частности плесени. После окончания посадки грибницы компост накрывают сверху газетами, либо другой, хорошо впитывающей воду бумагой. Такая предосторожность необходима, поскольку ею обеспечивается защита от попадания на компост спор возбудителей инфекции. Также поддерживается стабильная влажность и, наконец, обеспечивается в питательной среде высокий уровень углекислого газа. Газ получается в результате обмена веществ в тканях грибницы и служит хорошим стимулятором ее развития (до периода плодоношения).
После посева грибницы необходимо следить за тем, чтобы прикрывающий бумажный слой был постоянно влажным. Для этого его поливают из лейки с мелким ситечком. При этом ни в коем случае нельзя допускать попадания воды внутрь субстрата. По мере подсыхания верхнего слоя с бумагой увлажнение повторяют.
Посадку грибницы осуществляют при температуре субстрата, не превышающей 25°. В случае, если значение температуры оказывается выше, ждут пока оно не понизится до нормы. Если в течение нескольких дней температура не понижается и субстрат продолжает гореть, то это свидетельствует о незаконченности процесса ферментации. Здесь требуется помочь микроорганизмам, осуществляющим ее, ускорить их деятельность. Для этого субстрат разрыхляют, увеличивая доступ кислорода. Вследствие данного приема микроорганизмы испытывают приток свежих сил, что позволяет им быстрее сыграть свою роль в окончательном разложении субстрата.